Τελ. ενημέρωση:
   13-Jan-2026
 

Αρχ Ελλ Ιατρ, 43(2), Μάρτιος-Αρίλιος 2026, 258-262

ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΗ ΕΡΓΑΣΙΑ

In-silico πρόβλεψη των ειδικών για τη VP2 Β- και Τ-κυτταρικών επιτόπων
ως δυνητικών στόχων εμβολίου κατά του παγκοσμίως διαδεδομένου ανθρώπινου μποκαϊού 1

Κ. Γούπου,1 Χ. Χατζόγλου,1 Κ.Ι. Γουργουλιάνης,2 Σ.Γ. Ζαρογιάννης,1 Ε. Ρούκα3
1Τμήμα Φυσιολογίας, Ιατρική Σχολή, Σχολή Επιστημών Υγείας, Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας, Βιόπολις, Λάρισα,
2Πνευμονολογική Κλινική, Σχολή Επιστημών Υγείας, Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας, Βιόπολις, Λάρισα,
3Τμήμα Νοσηλευτικής, Σχολή Επιστημών Υγείας, Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας, Γαιόπολις, Λάρισα

ΣΚΟΠΟΣ Η πρόβλεψη επιτόπων Β- και Τ-κυττάρων στην καψιδιακή πρωτεΐνη VP2, η οποία έχει ταυτοποιηθεί ως δυνητικός στόχος του εμβολιασμού κατά του HBoV1.

ΥΛΙΚΟ-ΜΕΘΟΔΟΣ Η αλληλουχία της VP2 σε μορφή FASTA ελήφθη μέσω του UniProt και το Phyre2 χρησιμοποιήθηκε για την τρισδιάστατη μοντελοποίηση. Η αντιγονικότητα της VP2 υπολογίστηκε με το Vaxijen έκδοση 2.0. Οι επίτοποι των Β-κυττάρων προβλέφθηκαν με το εργαλείο IEDB ElliPro. Οι επίτοποι MHC τάξης I και II προσδιορίστηκαν με τη μέθοδο Vaxitop του Vaxign. Οι επίτοποι MHC I ελέγχθηκαν με το εργαλείο ανοσογονικότητας του IEDB και οι προσδέτες MHC II με τον διακομιστή IFNepitope. Τα αντιγόνα ελέγχθηκαν ξεχωριστά για τον κίνδυνο πρόκλησης αλλεργίας και τοξικότητας, καθώς και για την πιθανότητα πρόκλησης αυτοανοσίας μέσω των εργαλείων AllerTOP έκδοση 2.0, Toxin Pred και Peptide Match, αντίστοιχα. Οι φυσικοχημικές ιδιότητες προσδιορίστηκαν μέσω του Expasy ProtParam.

ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΑΤΑ Η ανοσοπληροφορική ανάλυση οδήγησε στην ταυτοποίηση ειδικών για τη VP2 Β- και Τ-κυτταρικών επιτόπων που πληρούν τις προϋποθέσεις για τον σχεδιασμό εμβολίου.

ΣΥΜΠΕΡΑΣΜΑΤΑ Τα ευρήματά μας επιβεβαιώνουν την αντιγονικότητα της VP2 και υποδεικνύουν υποψήφιες γραμμικές αλληλουχίες Β- και Τ-κυττάρων κατάλληλες για in vitro επικύρωση.

Λέξεις ευρετηρίου: Αναπνευστική λοίμωξη, Ανθρώπινος μποκαϊός, Ανοσοπληροφορική, Επίτοποι, Καψιδιακή πρωτεΐνη.

© Αρχεία Ελληνικής Ιατρικής